在使用塑料瓶中，塑料瓶的卫生不卫生是我们比较关心的，尤其是对瓶盖的关注。因为在饮用的时候瓶盖往往直接跟我们的嘴巴接触，如果说瓶盖上有不干净的东西，有可能在饮用中有可能被带入人体。所以对塑料瓶瓶盖除菌是生产工艺中不可或缺的一到工序。
瓶盖除菌的方式主要有以下几种：
喷冲式：利用多组喷嘴，进行多个方向喷射除菌水，从而对饮料瓶盖表面除菌，对喷射的时间也有要求，要保正微生物能被全杀灭。具体方法为：经过理盖后的饮料瓶盖方向一致地进入瓶盖轨道，在轨道的上下方设有多组喷头，每组喷头可以从不同角度对饮料瓶盖喷射除菌水，喷射的除菌水既对瓶盖进行除菌也推动瓶盖沿着轨道前行。
浸泡式：是把塑料瓶瓶盖浸泡在除菌水中，使瓶盖整体接受除菌水的清洗。浸泡时间也要根据除菌水的强度而定，一般具有强氧化性的除菌水浸泡时间在10~20秒时间内即可满足瓶盖全除菌的时间要求。一种方法是：方向一致的饮料瓶盖固定在瓶盖架上，瓶盖架连接在链条上，链条的运动带动瓶盖架进入装有除菌水的除菌池内并使瓶盖全浸泡在除菌水中，饮料瓶盖浸泡时间在10~20秒时间内即可满足瓶盖全除菌的时间要求。与喷冲除菌方式一样，除菌水浸泡后的瓶盖同样需要无菌水的喷洗和无菌空气的喷冲，使液体瓶盖既干燥又无菌。
